1 - مركز مطالعات و تحقيقات شيعه شناسي
2 - دانشگاه مفيد(ره)(شامل گروههاي اقتصاد،حقوق،فلسفه وسياسي)
3 - پژوهشكده حوزه و دانشگاه
4 - كتابخانه بزرگ آيت الله مرعشي نجفي و گنجينه جهاني مخطوطات اسلامي وحمايت از ميراث فرهنگي مكت
5 - مركز مطالعات و تحقيقات اديان و مذاهب
6 - مركز تحقيقات اسلامي جانبازان
7 - موسسه آموزشي و پژوهشي امام خميني قدس سره
8 - موسسه تحقيقاتي لوا
9 - موسسه فرهنگي طه
10 - موسسه فرهنگي در راه حق